采用足部反射区疗法治疗疾病时，选取反射区的原则，主要是根据病变所在的部位（一般指受累的脏腑器官），而不是根据具体的病症。因此，同一器官、同一系统的各种病症，可选取大致相同的反射区，反之，同一反射区可用以治疗不同的病症。如按摩甲状腺反射区既可治甲状腺机能亢进，也可治甲状腺机能减退。又如各种胃的病症都要按摩胃反射区，等等。
全足按摩与重点按摩：
对于慢性病，一般采取“全足按摩，重点加强”的办法。所谓全足按摩，即把所有的反射区都按摩一遍。全足按摩的作用是：①促进血液循环；②增强全身机能（不仅使患病的器官，而且使各个器官都得到加强，反过来又会影响患病的器官）。只有进行全足按摩才能达到保健治疗的目的，不能偷工减料。所谓重点加强，指根据具体的病选取某些重点反射区，在全足按摩的基础上加强按摩（在按摩次数上、力度上加强刺激），以收到治病的效果。对于急性病，可只选取重点反射区进行重手法按摩，重点突出，可收速效。急性期过去后再转入保健按摩。比如，急性胃痛，急性牙痛等等。
重点按摩时反射区的配方包括三部分反射区：
①基本反射区：即肾- 输尿管- 膀胱这三个反射区，作用是增强排泄功能，将“毒素”或有害物质排出体外
。因此在足部反射区按摩中起重要作用，无论治疗按摩或保健按摩，在按摩开始时和结束时都要反复按摩三遍。
②主要反射区：指与病变器官或系统相对应的反射区。前面已经提到，选取反射区的原则是根据病变所在的部位，而不是具体的病症。例如：
各种眼病——眼反射区；
各种耳病- 耳、内耳迷路反射区；
各种鼻病——鼻、额窦、扁桃腺、肺及支气管等反射区；
各种支气管疾病——肺及支气管、鼻、扁桃腺等反射区；
肺部疾病——肺及支气管、喉与气管、心等反射区；
胃及十二指肠疾病——胃、十二指肠、腹腔神经丛、甲状旁腺等反射区；
食管疾病- 喉与气管及食管、胃、胸等反射区；
各种肝病——肝、脾、胃、肠等反射区；
各种胆囊病——肝、胆囊反射区
小肠疾病- 小肠、腹腔神经丛、甲状旁腺等反射区；
大肠疾病——小肠、回盲瓣、盲肠、升、横、降结肠，乙状结肠及直肠、肛门、腹腔神经丛等反射区；
前列腺病症——前列腺、尿道、垂体、甲状旁腺、生殖腺、肾上腺等反射区；
垂体病症——垂体、头部反射区；
甲状腺病症——甲状腺、垂体、肾上腺、小脑及脑干等反射区：
甲状旁腺病症——甲状腺、甲状旁腺反射区；
肾上腺病症——肾上腺、垂体反射区；
睾丸疾病——生殖腺，垂体、头部、肾上腺、甲状腺等反射区；
卵巢疾病——生殖腺、垂体、头部、肾上腺等反射区；
皮肤病——脾、肾上腺、甲状旁腺、淋巴腺、胃肠等反射区；
③相关反射区；
根据不同性质的病来配备。例如各种炎症，应选取脾，淋巴腺、肾上腺、甲状旁腺、扁桃腺等反射区；
发烧：选取垂体、肾上腺、脾、淋巴腺、甲状旁腺、扁桃腺等反射区。
各种癌症（增加免疫能力），应选取脾、淋巴腺、肾上腺、甲状腺、甲状旁腺等反射区；
哮喘应取肾上腺反射区；等等。
此外还可根据脏腑器官的相关性质去选取不同的反射区。总之，足部反射区疗法，选取反射区的大致方向就是这样的，在实践中我们还会不断的归纳总结。（附言，广大读者如有问题可以留言评论，谢谢。）
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